Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms