Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE4BQ07343 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms