Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBXN1Q04323 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN1Q04323 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms