Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP1Q00587 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms