Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms