Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HBBP68871 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HBBP68871 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms