Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2IP63279 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms