Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNAP25P60880 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms