Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NME5P56597 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NME5P56597 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms