Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCR4P51679 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCR4P51679 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms