Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLK1P49759 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLK1P49759 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms