Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CRATP43155 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CRATP43155 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CRATP43155 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms