Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5CP41229 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms