Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms