Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms