Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA6P31267 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms