Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRDX6P30041 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms