Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CASP1P29466 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP1P29466 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP1P29466 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms