Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMB5P28074 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMB5P28074 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms