Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM21P19474 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM21P19474 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms