Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NR2F1P10589 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms