Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms