Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CT47B1P0C2W7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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