Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC4P09017 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms