Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1AO95602 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms