Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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