Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSVO60911 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSVO60911 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSVO60911 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSVO60911 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms