Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN2O60636 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms