Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf172C9J069 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf172C9J069 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms