Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms