Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF22A3QJZ6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms