Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC144AA2RUR9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms