Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BIVM-ERCC5R4GMW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
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