Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GIT1Q9Y2X7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms