Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM2AQ9Y2K7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms