Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNRF3Q9ULT6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNRF3Q9ULT6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms