Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRM2Q9UI43 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRM2Q9UI43 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms