Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms