Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APEX2Q9UBZ4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APEX2Q9UBZ4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APEX2Q9UBZ4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APEX2Q9UBZ4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APEX2Q9UBZ4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APEX2Q9UBZ4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms