Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COPS7AQ9UBW8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS7AQ9UBW8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS7AQ9UBW8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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