Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPB1Q9UBR1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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