Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A6Q9P2U8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms