Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL9Q9P2J3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms