Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP35Q9P2H5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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