Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ABI3Q9P2A4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms