Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARPBPQ9NWS1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms