Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBQLN4Q9NRR5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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