Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BPIFA1Q9NP55 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms