Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIN28AQ9H9Z2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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