Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
COMMD5Q9GZQ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms